游戏拿监狱作为开局,往往都是证明萨姆进监狱之前发生了很多错综复杂的事情。游戏一开始也是一段脱狱行动,你需要冲破牢笼逃离监狱,只不过不像从前的三代,你这此不是单独行动。一向内向、沉默的萨姆居然在监狱中结交了一个朋友,杰米·华盛顿,路易斯安那州知名惯犯,从前在新奥尔良的犯罪组织John's Brown army(约翰的褐军?)。关于这个家伙就说这么多。
终于从狱中成功逃出,萨姆和杰米来到了杰米的老巢John's Brown army。萨姆将John's Brown army作为自己的新基地,取代了从前的第三梯队。萨姆也有了新的搭档,武器专家William Redding,他取代了从前的电脑专家ANNA。John's Brown army的老大暨创始人是Emile Dufraisne,第二把交椅由Carson Moss来坐。团伙中还有一名重要人物就是化学专家Enrica Villablanca。
这些人与萨姆的关系是整个游戏情节的关键所在,游戏中没有哪个人是完全清白的,这明显是特指萨姆本人。John's Brown army就是一个有组织犯罪的团伙,这个团伙会给你一些任务,你要尽可能保住你最后的一点正义底线,同时还要完成他们给的任务。这么看来,基本上就可以清楚了,萨姆的确是做卧底的。